阔纳齐兰遗址位于柯坪县阿恰勒镇齐兰村东约7千米的荒漠中，遗址地处柯坪县阿恰勒平原上，地势北高南低。1983年，国家文物局和新疆维吾尔自治区博物馆联合组成南疆重点文物普查队来此调查。遗址平面呈长方形，南北长122米，东西长110米。东墙保存较好，南北端有碉堡遗迹，南部碉堡平面呈长方形，南北长9米、东西长20米、残高约5米，顶部建筑坍塌无存，夯筑而成；北部碉堡保存较好，平面呈正方形，边长约12米，可见顶部的堆堞。南北碉堡之间有一道墙垣，长约90米，其上有整齐的堆堞，间距0.5米，残高约3.9米。城门设于城墙中部，墙基夯筑而成，其上为土坯建筑。南墙及西墙南端可见墙基痕迹，北墙破坏严重。遗址内有长方形建筑物，破坏严重，可见砖等，构筑法与碉堡不同。该遗址曾出土“光绪通宝”钱币。
阔纳齐兰遗址是南疆保存较好的大规模的清代建筑遗址，它的单元布局和建筑风格深受中国传统建筑文化的影响，保持了中国古代建筑的传统作法，具有鲜明的中原古代建筑文化艺术和地方特色，对研究清代新疆建筑风格具有较高的历史、艺术和科学价值。
2013年，阔纳齐兰遗址由国务院公布为第七批全国重点文物保护单位。
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